1978年，721工人職工大學(xué)開始招生，1981年第一屆畢業(yè)生正式取得國家承認(rèn)的大專學(xué)歷。

1980年8月6日，第四機(jī)械工業(yè)部四教字〔1980〕1372號(hào)批復(fù)建立南京電子管廠職工大學(xué)。

1982年7月12日，江蘇省人民政府蘇政復(fù)〔1982〕51號(hào)文件，南京市機(jī)械工業(yè)局將所屬的南京機(jī)床廠、南京第二機(jī)床廠、南京微分電機(jī)廠、南京工藝裝備廠和南京油泵油嘴廠五大企業(yè)辦職工大學(xué)合并組建了南京市機(jī)械工業(yè)局職工大學(xué)，并報(bào)江蘇省人民政府批準(zhǔn)、國家教委批復(fù)備案。1992年，南京汽輪電機(jī)廠職工大學(xué)并入，學(xué)校經(jīng)市人民政府批準(zhǔn)更名為南京機(jī)械工業(yè)職工大學(xué) 。

1985年南京電子工業(yè)聯(lián)合職工大學(xué)成立，由原電子工業(yè)部所屬的南京無線電廠職工大學(xué)、南京電子管廠職工大學(xué)、南京長(zhǎng)江機(jī)器制造廠職工大學(xué)、第十四研究所職工大學(xué)、南京有線電廠職工大學(xué)、南京華寧聯(lián)合職工大學(xué)等六所獨(dú)立設(shè)置的、經(jīng)國家教委備案的職工大學(xué)聯(lián)合組成，隸屬江蘇省電子工業(yè)廳。1992年，在原中電總公司教育局、江蘇省電子工業(yè)廳、南京市人民政府、中山集團(tuán)及各辦學(xué)單位的共同努力下，經(jīng)江蘇省教委和國家教委批準(zhǔn)，聯(lián)合成立了教學(xué)實(shí)體型的南京電子工業(yè)職工大學(xué)。根據(jù)南京市政府關(guān)于《批轉(zhuǎn)市二教局關(guān)于南京市成人高校布局調(diào)整意見》寧政發(fā)〔1992〕225號(hào)文的通知精神，聯(lián)合后的校名為“南京電子工業(yè)職工大學(xué)”。

在省、市教育主管部門的關(guān)心下，南京機(jī)械工業(yè)職工大學(xué)、南京電子工業(yè)職工大學(xué)分別于2000年、2001年取得了普通高校招生資格。

2001年，南京電子工業(yè)職工大學(xué)在江蘇省信息產(chǎn)業(yè)廳和南京市教育局的支持下，由學(xué)校的主辦單位之一南京三樂集團(tuán)有限公司（南京電子管廠）投資，電子職大與南京機(jī)電產(chǎn)業(yè)集團(tuán)下屬的國營南京半導(dǎo)體器件總廠簽訂了土地出讓（補(bǔ)償）協(xié)議，開始建設(shè)學(xué)校的新校區(qū)。 

2005年12月，根據(jù)南京市人民政府《關(guān)于組建南京機(jī)電職業(yè)技術(shù)學(xué)院的請(qǐng)示》寧政發(fā)〔2005〕153號(hào)文的精神，由原南京審計(jì)學(xué)院院長(zhǎng)時(shí)家駿、金陵科技學(xué)院院長(zhǎng)閔光泰、省發(fā)改委助理調(diào)研員戚玉松、省教育廳發(fā)展規(guī)劃處處長(zhǎng)朱衛(wèi)國、省教育廳發(fā)展規(guī)劃處副處長(zhǎng)張鯉鯉、南京市教育局副局長(zhǎng)洪偉、南京市教育局發(fā)規(guī)處處長(zhǎng)黃輝、南京市教育局高師處處長(zhǎng)過小平等一行蒞臨學(xué)校進(jìn)行組建南京機(jī)電職業(yè)技術(shù)學(xué)院的評(píng)估檢查工作。

2006年4月3日，江蘇省人民政府《關(guān)于同意建立南京機(jī)電職業(yè)技術(shù)學(xué)院的批復(fù)》蘇政復(fù)〔2006〕33文同意南京機(jī)械工業(yè)職工大學(xué)、南京電子工業(yè)職工大學(xué)合并組建南京機(jī)電職業(yè)技術(shù)學(xué)院。

2006年，南京市人民政府為加快高等職業(yè)教育體制改革步伐，優(yōu)化高等教育布局結(jié)構(gòu)，提高教育質(zhì)量和辦學(xué)效益，更好地為“兩個(gè)率先”服務(wù)，2006年7月24日南京市人民政府《關(guān)于建立南京機(jī)電職業(yè)技術(shù)學(xué)院的通知》寧政發(fā)〔2006〕158號(hào)決定正式合并組建南京機(jī)電職業(yè)技術(shù)學(xué)院，同時(shí)撤銷南京機(jī)械工業(yè)職工大學(xué)、南京電子工業(yè)職工大學(xué)建制。南京機(jī)電職業(yè)技術(shù)學(xué)院為專科層次的普通高等學(xué)校。

2009年7月，由南京機(jī)電產(chǎn)業(yè)集團(tuán)公司出資收購了原電子工業(yè)職工大學(xué)的全部股分，學(xué)校成為機(jī)電產(chǎn)業(yè)集團(tuán)公司的全資直屬單位。

2009年10月順利完成了學(xué)校事業(yè)單位登記注冊(cè)和法人登記手續(xù)（寧編辦字〔2009〕23號(hào)）。

為貫徹中央加強(qiáng)職業(yè)教育的決策部署，優(yōu)化南京市職業(yè)教育布局，支持高淳區(qū)高質(zhì)量發(fā)展，2019年5月市委市政府決定機(jī)電學(xué)院遷建高淳。2021年1月、2023年10月，高淳校區(qū)一期、二期項(xiàng)目陸續(xù)建成，并投入使用，學(xué)校辦學(xué)條件得到明顯改善。